肛門塞劑通常用於不方便口服及意識不清的患者，例如嚴重嘔吐、昏迷。缺點是塞劑容易造成肛門疼痛，大便時亦會疼痛，甚至於引起腹瀉及反射性肚子痛。

此外，因為塞劑在肛門內溶化的時候，有時會刺激該處的腸黏膜，造成紅腫，潰瘍等。

醫學上很多退燒藥都有做成口服劑與塞劑兩種劑型，如果一樣的劑量無論口服或塞劑其效果是完全相同的，若家長的感覺不同，則純屬個人心理問題。
 

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